Dekodeeritud Euroopa pöögi genoom

Teadlased järjestavad Saksamaa tähtsaima lehtpuu täieliku genoomi

Ajalooga puu: Euroopa pöök võib elada kuni 500 aastat. © Conrad Amber / CC-ny-sa 4.0
ettelugemist

Raamatus uuriti geene: Teadlased on dekodeerinud Euroopa pöögi täieliku genoomi - kõige tavalisem lehtpuu Eestis. Oma analüüsis tuvastasid nad umbes 130 000 pöögigeeni. Genoomi uurimine aitab muu hulgas tuvastada geneetilist kohanemist, mis muudab puud kliimamuutuste mõjude suhtes vähem haavatavaks.

Euroopa pöök (Fagus sylvatica) on Saksamaal kõige levinum lehtpuu, mille osakaal on umbes viisteist protsenti. Kuni 50 meetri kõrgused puud võivad jõuda 500 aasta vanuseni ja on oluliseks elupaikaks arvukatele seentele, putukatele ja lindudele. Uuringud näitavad, et ainuüksi sellel taimel võib elada kuni 180 putuka- ja lestaliiki. Lisaks on pööbipuud aastase mõjuga umbes seitse miljonit ruutmeetrit üks olulisemaid lehtpuid kui kasulik ja tööstuslik puit.

Tulevikus muudavad kliimamuutused pööbli pööbimise nende koduriigis raskeks. Suurenev põud ähvardab - seisundit, millega niisket parasvöötme kliimat armastavad liigid halvemini toime tulevad. Euroopa pöögi kohanemisvõime ja ökoloogia kohta lisateabe saamiseks on Marco Thines Frankfurdi Senckenbergi bioloogilise mitmekesisuse ja kliimauuringute keskusest ja tema kolleegid nüüd puu otsa vaadanud.

Pöögi küpsed viljad © Gerhard Elsner / CC-by-sa 3.0

130 000 pöögigeeni

"Meil on õnnestunud dešifreerida selle tõenäoliselt kõige olulisema Euroopa metsapuu täielik genoom, " teatab Thines. Sel eesmärgil analüüsis töörühm umbes 300-aastase Euroopa pöögi proovi umbes 5700 hektaril Hesseni põhjaosas Kellerwald-Edersee piirkonnas. "Valisime sellise vana varupuu, et välistada tänapäevase metsanduse mõju puule, " selgitab teadlane.

Vaadates genoomi, tuvastasid teadlased kokku umbes 130 000 punase pöögi geeni. Andmetest selgus muu hulgas, et arvukad seeneliigid, kes elavad pöögiga sümbiootilises koosluses, ei vaheta oma geene puudega. "See näitab veel kord, et geeniülekanne pole iseenesestmõistetav asi, " ütleb Thines. kuva

Kliimamuutustega kohanemine

Koos genoomijärjestusega on teadlastel käsil tööriist tulevasteks kaitseuuringuteks - näiteks Saksamaa metsade geneetilise mitmekesisuse tuvastamiseks või kuivresistentsuse jaoks oluliste genoomi komponentide leidmiseks on.

"See tuvastab genotüübid, mida saab istutada kliimamuutustega kohanemiseks, " lõpetab Thines. Euroopa pöögi täielik genoom on teinud teadlased ekspertidele Internetis kättesaadavaks.

(Senckenbergi teadusinstituut ja loodusmuuseumid, 12.12.2017 - DAL)